Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms