Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms