Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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