Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDE1Q9NXR1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms