Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms