Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms