Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCSER1Q9C0I3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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