Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLRP1Q9C000 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms