Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ROPN1BQ9BZX4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms