Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-86P-201ENST00000410135 219 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01377-201ENST00000505396 649 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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KRTAP9-3Q9BYQ3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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