Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZBED2Q9BTP6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms