Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms