Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMCHL2Q9BQD1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms