Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAT1Q99536 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms