Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms