Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CMTM3Q96MX0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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