Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms