Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UPRTQ96BW1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UPRTQ96BW1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms