Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNF34Q969K3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNF34Q969K3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms