Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms