Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPDL3AQ92484 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms