Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC12Q8WUD4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms