Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BEST4Q8NFU0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BEST4Q8NFU0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BEST4Q8NFU0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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