Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHE22Q8NFJ8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms