Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGDNQ8NEJ9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms