Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMER3Q8N944 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMER3Q8N944 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms