Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms