Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUP54Q7Z3B4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NUP54Q7Z3B4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms