Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCSK4Q6UW60 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms