Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms