Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms