Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms