Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM164Q5U3C3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms