Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms