Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LETM2Q2VYF4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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