Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Q1T7F1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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