Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RTN1Q16799 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RTN1Q16799 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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