Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HIST3H3Q16695 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HIST3H3Q16695 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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