Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF239Q16600 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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