Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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SCN9AQ15858 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCN9AQ15858 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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SCN9AQ15858 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SCN9AQ15858 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SCN9AQ15858 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCN9AQ15858 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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