Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA2Q15822 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms