Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRD3Q15059 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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