Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMD6Q15008 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms