Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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