Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2DQ13557 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms