Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRIM32Q13049 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM32Q13049 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms