Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
STRN3Q13033 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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