Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AP1B1Q10567 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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