Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOBRQ0VD83 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms