Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FAM27E3Q08E93 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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